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RNA 2'-O-methylation promotes persistent R-loop formation and AID-mediated IgH class switch recombination - 면역글로불린 전환에 있어 R-loop 안정화 메커니즘 규명

본 연구는 면역글로불린 클래스 전환(class switch recombination, CSR) 과정에서 핵심적인 역할을 수행하는 RNA-DNA 하이브리드 구조인 R-loop가 어떻게 안정적으로 유지되는지를 분자생물학적 수준에서 규명한 논문이다. 연구팀은 특히 RNA의 2′-O-메틸화(2′-O-methylation, 2′-OMe)가 R-loop의 분해를 방지하고 CSR을 가능하게 하는 중요한 메커니즘임을 밝혀냈다. 이 과정을 담당하는 효소는 Fibrillarin(FBL)이며, 이는 AID(activation-induced cytidine deaminase)와 그에 결합하는 snoRNA인 aSNORD1C와 상호작용함으로써 IgH 영역에서 특이적인 2′-OMe를 유도한다. 본 논문은 RNA의 화학적 변형이 면.. 카테고리 없음 2025. 3. 26.

Identifying Disulfidptosis Subtypes in Hepatocellular Carcinoma: 머신러닝 기반 분석과 면역치료 연관성 탐색

본 블로그 글에서는 Chen et al. (2024)의 논문 "Identifying disulfidptosis subtypes in hepatocellular carcinoma through machine learning and preliminary exploration of its connection with immunotherapy"를 리뷰합니다. 해당 연구는 간세포암(HCC)에서 새롭게 규명된 세포 사멸 메커니즘인 disulfidptosis를 기반으로 한 분자 아형을 정의하고, 머신러닝 및 생물학적 실험을 통해 이 아형과 면역치료 간의 연관성을 심층적으로 분석한 것입니다. 특히, 저자들은 disulfidptosis 연관 유전자(disulfrg) 발현 데이터를 활용해 환자군을 분류하고, 새로운 예측 .. 카테고리 없음 2025. 3. 26.

Integration of mult-omics and nucleotide metabolism reprogramming signature analysis reveals gastric cancer immunological and prognostic features – 논문 리뷰

이 논문은 위암(Gastric Cancer, GC)의 면역학적 특징과 예후 예측력을 분석하기 위해 다중 오믹스 데이터를 통합하고, 핵산 대사 재프로그래밍에 주목한 독창적인 접근을 제시한다. 연구진은 TCGA 및 GEO 데이터베이스의 데이터를 활용해 핵산 대사 관련 지표(Nucleotide Metabolism-Related Index, NMRI)를 구축하고, 이를 기반으로 위암 환자군을 분류하였다. NMRI는 4개의 핵심 유전자(GAMT, ORC1, CNGB3, SERPINE1)를 기반으로 하며, 이 지표는 위암 환자의 생존율뿐만 아니라 면역 치료 반응 예측에도 유의미한 예측력을 보였다. 특히 SERPINE1 유전자의 역할을 in vitro 실험으로 검증함으로써 그 기능적 중요성을 입증했다. 본 논문은 면.. 카테고리 없음 2025. 3. 26.

망막 질환 병태생리에 미치는 세포외 소포의 기여: 혈액-망막 장벽 기능장애를 중심으로

본 리뷰에서는 Martins et al.이 2024년 Journal of Biomedical Science에 발표한 리뷰 논문, "Contribution of extracellular vesicles for the pathogenesis of retinal diseases: shedding light on blood-retinal barrier dysfunction"을 다룹니다. 이 논문은 당뇨망막병증(DR)과 노인성 황반변성(AMD) 같은 망막퇴행질환의 발병 과정에서 세포외 소포(extracellular vesicles, EVs)가 어떤 방식으로 병태생리를 조절하고, 특히 혈액-망막 장벽(blood-retinal barrier, BRB)의 기능장애에 어떤 영향을 미치는지를 체계적으로 정리한 고찰입니다... 카테고리 없음 2025. 3. 26.

대식세포 기반 위험 예측 시그니처 개발: 대장암에서 TAM-M2 통합 분석을 통한 분자적 이질성 해석

본 논문은 대장암(colorectal cancer, CRC)에서 종양 연관 대식세포(tumor-associated macrophages, TAMs)와 그 중 면역억제적 성향을 가진 M2 대식세포의 분자적 기전을 통합적으로 분석하고, 이와 관련된 위험 예측 시그니처(TAMM2RS)를 개발한 연구이다. 단일세포 RNA 시퀀싱(scRNA-seq)과 벌크 RNA 시퀀싱 데이터를 통합하여 TAM과 M2 대식세포의 마커 유전자를 규명하고, LASSO Cox 회귀 분석을 통해 예후 관련 유전자를 선별하였다. 또한 실제 세포주 실험 및 면역조직화학, 항암제 민감도 예측을 통해 생물학적, 임상적 유효성을 다각도로 검증하였다.연구 배경 및 중요성대장암은 전 세계적으로 발병률과 사망률이 높은 주요 암종이며, 다양한 분자적 .. 카테고리 없음 2025. 3. 25.